大部分活生物体都需要呼吸氧气，鱼类用腮从水中获取氧气，如果可利用的氧气太少或鱼类无法获取足够的氧气时，其健康将受到不利影响。氧气通过在水面/空气的接触扩散进入水。如果表面被搅动或不断移动，则空气/水界面会增加，氧气将更容易进入水中。
由于鱼类和植物等生物的呼吸作用，水中的氧气量减少。同时，细菌还使用大量的氧气来分解废有机物。如果水族箱中有大量有机物，那么细菌会将有效氧气减少到危险的低水平。鱼所需的氧气量取决于鱼的类型，更大，更活跃的鱼需要更高的氧气水平。有些物种可以呼吸大气，因此水中的氧气含量对它们而言并不重要。
氧气含量也随着温度的升高而降低。 在夏天这有时会引起问题，尤其是在池塘中。在这里，较高的温度通常与增加的有机负荷以及植物或藻类生长的开花相吻合，所有这些共同作用降低了氧气含量。
植物作为增氧机
通常为了增氧而在水族箱中栽培植物。有些植物甚至被统称为“ 增氧剂”。植物在进行光合作用同时有呼吸作用，他们两者之间并不矛盾，因为两者之间进行的场所不同。白天，植物利用阳光作为能源进行光合作用，该过程的副产品是氧气，光合作用产生的氧气量大于呼吸所需的氧气量。夜晚，呼吸作用继续进行，光合作用停止，结果就是水中的氧气被消耗而二氧化碳增加。如果池塘或水族馆植物过多，地表水的流动很少，则在黑暗期间氧气浓度可能会降低到较低水平。
过饱和
水中的氧气过多时对鱼类也非常危险。 饱和度是水可以容纳的最大溶解氧量。水的饱和度会随温度而变化。由于密集的种植和高强度的光照导致大量的光合作用，或者由于藻类大量繁殖，这种情况下（大量氧气产生），鱼的血液也变得过饱和，在过饱和的水中，氧气迅速从水中释放出来，并产生小的气泡。这种情况也可能在鱼的血液中发生，皮肤下面，头部和眼睛中可能会形成水泡，可能会导致致命的后果。要纠正这种情况，请安装足够的交换装置，这有助于在水面交换气体，从而释放过多氧气以及引入适当的氧气。
上图：氧气通过表面进入水中。如果通过泵或过滤器的搅拌大大增加了表面积，则更多的氧气会进入（或离开）水中。
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