有机化学合成实验室的设计重点就是在追求高效实验的同时，使实验室内空气环境优良，减少因实验带来的危害。为了保证实验室的空气环境，有机化学合成实验室在有害气体输出系统、特殊气体配送系统等方面的设置都非常谨慎。
比如，在吉林大学以及CEIDI西递的多个有机化学合成实验室项目中，设计人员均会采用通风设备等装置控制进排气，以达到安全经济的效果。在CEIDI西递的项目中，虽以通风柜为主，但我们还能看到原子吸收罩、万向排气罩、吸顶式排气罩、台上式排气罩等多种根据实际情况设置的设备。
有机化学合成实验室常会用到不燃气体、惰性气体、易燃气体、剧毒气体和助燃气体。因除不燃气体、惰性气体外其它气体不得进行实验室，所以其它气体需要通过输气管接到各实验室内。在吉林大学和CEIDI西递的多个项目中，我们均能看到为了避免泄露，设计人员在管线上的连接管件都连接了后焊接。提醒一下大家：所有的管线在安装完毕后一定要做气密性实验，并在使用前要先除油。由于管道细小，管间距小，安装过程中可依据现场情况进行调整，保证间距不小于45mm，气瓶装瓶时，易燃易爆与惰性气体同柜，杜绝两种易燃气体同瓶装一柜。
实验室内容、用途和规模的不同，装修设计也会有所差异。
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